清-顺治年间

清顺治元年（1644年），清朝入主中原，统一全国，并逐步建立起对西藏地区的直接统治。

17世纪到18世纪

从17世纪到18世纪，清朝属国和硕特汗国时期及其以后，西藏政治相对稳定，社会相对安宁，拉萨城市发展相对较快。在此期间拉萨发生过两次较大的动乱，一次是清康熙五十六年（1717年）新疆准噶尔汗国入侵，一次是清雍正五年（1727年）前后藏发生战争，都由清朝中央派兵平息。特别是清雍正五年（1727年）到清乾隆五十三年（1788年）之间，除清乾隆十五年（1750年）郡王珠尔默特那木札勒被诛引起短暂的骚乱外，拉萨人过了整整50年没有社会动荡和战争硝烟的和平日子。在此期间拉萨修建了大量贵族府邸、活佛家庙、政府衙门，还有商店、作坊、茶楼、酒店、民宅等。这时，拉萨市区以大昭寺为中心向四面延伸辐射，不断扩大，东至清真寺，南至三怙主庙，西至琉璃桥，北到小昭寺，基本上形成了旧城区的格局。到清嘉庆年间，拉萨居民已有5000余户，人口达3万之多。

清-雍正年间

清雍正五年（1727年），清朝中央政府在西藏派驻驻藏大臣，衙署最早设在拉萨冲赛康。18世纪末在鲁布柳林西侧新建驻藏大臣衙门，拉萨市民称“朵森格”（石狮子）。清朝中央还在西藏派驻军队，军营设在拉萨北郊的扎什地方。

清-乾隆年间

清乾隆二十二年（1757年），七世达赖喇嘛圆寂后，乾隆皇帝在西藏实施摄政制度，即在前一辈达赖喇嘛圆寂至后一辈达赖喇嘛亲政之前，任命一位大活佛代行达赖喇嘛的职权，俗称摄政王。德穆活佛、策墨林活佛、热振活佛、功德林活佛，都曾出任过摄政王。他们先后在拉萨修建了高大雄伟、华美壮观的家庙。与此同时，历辈达赖喇嘛的家庭，大小僧俗贵族的府邸，也竞相在拉萨城区动工兴建。在布达拉宫以西约2千米处建起了罗布林卡，以后迭经扩建，成为占地36万平方米的大园林。由此形成以布达拉宫为中心，辐射八廓街、罗布林卡周围约3平方千米的拉萨古城。当时西藏商人、内地商人、不丹、尼泊尔、印度诸国商人，纷纷云集拉萨经商，冲赛康、铁奔康、坚布康、旺堆辛嘎、八廓街成为拉萨五大市场。伊斯兰教信徒聚居城东河坝林一带，大都以屠宰磨面为职业：汉族居民多住城南，种菜、配酒者居多。这一、二百年是拉萨第四次大规模建设时期，也是固始汗时期（前期是清朝属国和硕特汗国）的全盛时期。

清-光绪年间

清光绪十六年（1890年），中国同英国签订《中英会议藏印条约》，愤怒的三大寺僧人和群众予以强烈谴责。清光绪三十年（1904年），拉萨遭到英帝国主义侵略。许多喇嘛武装反抗，其他许多藏民也大刀和匕首，参加战斗。